In der Mitte des Gebäudes befindet sich eine reizvolle kleine Kapelle mit historischer Einrichtung, von außen durch ein gerahmtes Portal mit Stiftungsinschrift, Wappen und Kruzifix zu erkennen. In der kleinen Hauskapelle kann man z.B. einen spätgotischen Altar aus der Zeit um 1520 und eine barocke Orgel besichtigen.

1932 wurde das Anwesen des Präsidentenklosters von der Stadt Schleswig übernommen und unter Berücksichtigung der historischen Raumsituation modernisiert.

Heute beherbergt das Präsidentenkloster das Heimatmuseum der ostdeutschen Landsmannschaften und das Museum für Outsiderkunst, in welchem sich auch der heutige Zugang zur kleinen Hauskapelle befindet.